یکی از عمده دلایل از بین رفتن زیستگاه های تالابی و بالاخص دریاچه بختگان در نزدیکی شهرستان نی ریز در استان فارس، حفر چاه های مجاز و غیر مجاز و برداشت بی رویه آب از چشمه های موجود در اطراف تالاب هاست که باعث از بین رفتن زیست بوم منطقه و مهاجرت دائمی پرندگانی که در روز های پرآبی در جوار این دریاچه بوده اند شده است .
